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En eucariotas, la terminación de la transcripción ocurre cuando la ARN polimerasa alcanza la poliadenilación, 3′-5′-AAUAAA señal, en la región 3 ' UTR del mRNA. Entonces hay reclutamiento de un complejo de proteínas de corte, IPT (factor de escote y poliadenilación especificidad). El papel de este factor es doble: interactuando con ARN polimerasa, podrá resultar en la discontinuación de la transcripción y la separación de estos últimos; Entonces será RNA Cleave justo debajo de la señal AAUAAA, a nivel de una secuencia de tipo 3′-5′-YA, donde Y es una base pirimidínica (U o C).Tras el descanso, IPT reclutará la polimerasa poly(a) que sintetizarán una cola de poli (A) compuesta de 100 a 250 residuos adenyliques5. Esta cola poly(a) interpreta varios papeles, a través de la contratación de proteínas específicas, las PABP (Poly(a)) proteínas. La poliadenilación y la fijación de la PABP en mRNA son importantes para la exportación nucleaire6, protección contra las endonucleasas de restricción sino también 3′ - OH, pero especialmente para la traducción a proteínas (véase abajo).En las bacterias, la terminación del proceso de transcripción es diferente, va principalmente a través de la formación de una estructura secundaria en mRNA (terminator), que provoca la ruptura de la ARN polimerasa y su desprendimiento de la matriz de ADN. MRNA bacteriana no suelen Poliadenilatado 3′.
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